Puce à réactome : rétractation de l’article ?

By Guillaume – 29 juillet 2010Posted in: Vie scientifique

Une puce biochimique capable de décrypter une très grande partie de l’activité enzymatique d’une cellule, cela relève plutôt de la science-fiction. Aussi lorsque la scientifique espagnole Ana Beloqui et ses collègues publièrent dans la revue Science, en octobre 2009, avoir réalisé une puce à fluorescence contenant 1676 substrats d’enzymes différents, la nouvelle fit l’effet d’une bombe dans la communauté des biochimistes.
Malheureusement, la réalité est moins belle que cela. Après publication de l’article (1), des chimistes organiciens se sont interrogés sur la réelle faisabilité de cette puce, citant des erreurs dans les réactions enzymatiques décrites par les auteurs. Le 17 décembre 2009, l’éditeur en chef de la revue Science, Bruce Alberts, tirait la sonnette d’alarme. En conséquence, le Spanish National Research Council (CSIC) demandait en janvier dernier la formation d’un comité éthique pour enquêter sur cette affaire (2).
Les membres du comité ont désormais statué (3), et concluent que cet article n’aurait pas dû être publié en cet état. Les sages ne critiquent pas le sujet de recherche, certains d’entre-eux sont même convaincus que la méthodologie utilisée pourrait aboutir à la création d’une telle puce biochimique. Cependant, ils pointent du doigt les faiblesses et les erreurs de l’article. Des sanctions disciplinaires pourraient être prises à l’encontre des scientifiques du CSIC impliqués dans cette publication.
La « puce à réactome » pourrait-elle vraiment fonctionner ? David Cane, un biochimiste de la Brown University (USA) en doute. Dans chaque puits de cette puce, les substrats sont attachés à une molécule colorante et à un linker les retenant sur la surface de la puce. Mais ces liaisons chimiques pourraient suffisamment modifier leur conformation pour empêcher leur insertion au niveau du site catalytique de l’enzyme. David Cane pointe du doigt le fait que papier soumis par Beloqui et al. (2009) ne démontre en rien l’efficacité du système pour une enzyme donnée.
Une commission est actuellement mise en place pour auditionner le 11 août prochain les auteurs du Helmholtz Center (Braunschweig, Allemagne) impliqués dans cet article. Les responsables éditoriaux de la revue Science devraient, quant à eux, discuter avec les responsables des différents instituts et universités impliqués pour prendre une décision concernant cet article, actuellement toujours disponible en ligne.

Références :
(1) Beloqui, A. et al. (2010). Science 326(5950):252-257. doi:10.1126/science.1174094
(2) Abbott, A. Institutions investigate ‘reactome’ data. Nature News, 6 janvier 2010. doi:10.1038/463017a
(3) Abott, A. Retractation recommanded for enzyme-chip paper. Nature News, 28 juillet 2010. doi:10.1038/466540b